تقريبا راه خاصي جهت پیشگیری و جلوگیری از بیماری آبسه مقعدی وجود ندارد ولی رعايت نظافت شخصي و جلوگيري از يبوست يا اسهال شديد و عدم نزديكي از مقعد راهکارهای مهمی هستند که به پیشگیری از این بیماری کمک می نمایند همچنین درمان بيماريهايی مثل فيشر يا شقاق بسیار كمك كننده است.
